上古种子是一种顶级的作物，属于玩家后期时接触比较多的道具了。使用上古去酿酒的话，能够获得很高的的收益，基本是仅次于杨桃了。玩家在初次获得上古种子的时候，通过对物品描述的阅读，就会觉得它是一个有用的道具。自己尝试种植的时候才发现，怎么尝试都是无法将其种下的。这是因为玩家得到的只是一个古老的道具，需要将其提交到博物馆。博物馆为了奖励玩家的贡献，就会给到真正能种植的上古种子配方和种子。
看配方会发面，制造出能够种植的上古种子，也只需要一个不能种的就行。配方的意义相当于告诉玩家如何使用上古种子。无法种植的远古种子有六种法师获得，前期比较简单的办法就是挖特殊的土地获得。玩家看到黄泥地上有像蚯蚓一样探出的格子时，下面就藏着不能种植的远古种子。农场的南边和罗宾的家附近，都是有极低的概率会出现这种土地的。
另一种前期获得方式就是钓鱼，玩家在钓鱼的时候有极低的概率能钓到海底的宝箱。第三种方式需要玩家战斗，击杀幼年的苍蝇和臭虫也有几率爆出。一般山洞的前三十层都会有概率出，带上窃贼手套杀怪掉落远古种子的概率也会更高。前期如果运气不好，找不到对应的土地，或是钓鱼也没有开宝箱出种子的话，击杀小怪其实是相对更稳定的获取途径。后面在骷髅洞窟的史前层，地上的植物被破坏掉也是有着很高的概率出现种子。
