宝石和树种在合成之后，能够形成宝石果种子。将它种下之后，可长出宝石树。宝石树的生长是有一定的条件的，需在地下或者洞穴底层进行种植。所种的地表中，需要有至少两个的相邻石块。除了石块，它也能种在苔藓或者生物群落的变种上。虽然是在地下，但光源的有无不会影响到它的生长。需要注意的是，火把会对树有一定的阻止作用。不建议玩家用火把照明，就算要用火把，也要放置在树的两个图格之外。多个宝石树的种植需拉开，要间隔一定的距离。
一般来讲，每两个宝石树之间，最好能够间隔三格。有了三格间隔，才不会相互影响。宝石树隔一段时间后，会进行生长的尝试。尝试成功它的高度就会增加，尝试失败就只能种出矮树。生长失败所得到的矮树，其产出的宝石数量是比较少的。需要注意的是，如果它上方的空间低于十六物块，是有比较大的几率失败的。因此建议玩家将它的上面至少给留出十一物块空间，当然最好的是十六个。其实就算是十六个，宝石树在生长成功后，顶部的树叶也会和天花板叠在一起。
因此建议有条件的玩家，直接把上面的物块给留到十七个。宝石树整个树身的高度大约会占据七到十二个格子，为了保证其足够的生长空间，建议玩家将树与树之间的距离尽量拉远。距离越远，它生长的速度会越快。如果不小心把宝石树种得太近，玩家可将其所需的相邻空石块给锤击掉。想保证距离，玩家还能用智能光标辅助，进行种植。需要注意的是，在地下或者洞穴一定要放水。宝石树如果种好后，所种植的地块被水给淹了，那它就不会再继续生长。
