想使用分舰队，首先要升级分舰队指挥中心。这样就能向前哨、采矿平台部署三百指挥值的舰队。点击要派过去舰队的建筑，点击部署，就能向建筑派出自己的舰队。这个过程需要消耗四十策略值，并且是直接由基地曲率进入建筑里面，所以不用担心建筑被封锁。
等舰队到达之后，就能在左边的计划栏里看到它，并且能够从建筑里面派出来打架、封锁、驻守。甚至它也能够被别的船支援，只要是正常舰队能做的，它都能做到。当兵力被打有战损的时候，也能直接撤回分舰队，让它回到自己的建筑里进行自动维修，而且也能用预制模组进行维修。
舰队里如果有船爆炸了，也能从基地补充船只再过来，同样每次部署需要四十策略值。这里还可以保存配置的方案，方便下一次部署。想要撤回部署舰队的话，要先保证基地的军事港口剩余空间可以容纳这支舰队。
当然，也可以只撤回一小部分，每次消耗四十策略值。如果全部撤回，就相当于撤销了部署，就能对其它前哨平台进行部署了。这里要注意一下，不管是撤退还是部署，都要等舰队到达目的地之后才会生效。
如果当前部署的地方还有船的话，是不能够再向其它建筑派兵的。但是升到九本之后，还可以再解锁一个，也就是能部署两支舰队到不同的建筑里面去。这样看来分舰队的功能是不是很完美呢？
其实并非如此，因为它有一个致命的缺点。分舰队的船要是被打空血了必炸，所以这支舰队只能放纯输出的夹击队。或者把一些要用的船放在这里当做备份，比如打完城造船来不及了，直接从这里面派出去。
